ある日、土門鑑定所に西村民代（渡辺杉枝）が鑑定依頼にやって来る。
自ら命を絶った娘の遺品鑑定を希望しており、遺品の中に科捜研時代の土門誠（藤木直人）の名刺があって訪ねてきたとのことだった。
民代が娘・葉留佳（佐藤めぐみ）の名前を告げると土門は動揺。というのも、土門は当時捜査一課だった葉留佳と共に、7年前に発生した連続通り魔事件を捜査していたのだ。
さらに民代は、葉留佳が亡くなる前日に“7年前の事件の犯人に会ってくる”と電話してきたと明かすと、土門は依頼を引き受けることに。
民代が帰ると、土門は高倉柊子（白石麻衣）に通り魔事件について語り出す。
事件発生当初、被害者はケガだけだったが、犯行は次第にエスカレートしていき、ついに死者が出た。葉留佳は事件現場近くに住みついていたホームレスの真鍋を疑い、本人も自供したため逮捕。しかし、勾留中に真鍋が供述を変えてしまう。
土門も真鍋が犯人だという証拠を見つけられず、証拠不十分で釈放。誤認逮捕としてバッシングを受けた葉留佳は警察を辞め、土門も科捜研を去ったのだった。
調査を始めた土門は、葉留佳の部屋に残された遺品から途中のページが裂かれているノートを見つけ、そこに書かれていた内容を鑑定することに。また、クローゼットの中で不自然に空になっていたクリアボックスから残留物も採取した。
一方、高倉は尾藤宏香（松雪泰子）に7年前当時の話を聞き、葉留佳と同僚だった刑事に会いに行く…。
