土門誠（藤木直人）と高倉柊子（白石麻衣）のもとに、弁護士・相田直樹（迫田孝也）が新たな鑑定依頼にやって来る。
相田が弁護をすることになった水原佳南絵（川島海荷）は、自宅に押しかけてきた知人の寺井淳一（浜中文一）に襲われ、身を守るため鈍器で寺井の頭部を殴打して殺害。
証拠隠滅のために遺体を焼却したうえで警察に自首していた。
佳南絵は正当防衛を訴えるが、検察は証拠の隠滅を図った佳南絵の行動は悪質だと判断し、殺人罪で起訴しようとしていた。
正当防衛を立証するためには、遺体が寺井であることを証明する必要がある。しかし、遺体は激しく燃やされており警察は身元を特定できず。
また、遺骨からDNAを抽出できたものの、寺井には親族がいないうえに住所不定のため鑑定に必要な照合試料がなく特定には至らない。
焦る相田に対し、土門は「DNA鑑定以上に信頼できるものはない」と言い切った。
そんななか、鑑定所に佳南絵の婚約者・日野卓郎（浅香航大）が訪ねてくる。
佳南絵、寺井とは大学時代からの仲だと話す日野。さらに、婚約してからも佳南絵は寺井からしつこく交際を迫られていたことを明かし、彼女の正当防衛を訴えた。
高倉が日野の言葉に違和感を覚える一方、土門は寺井の痕跡を探すため事件現場に向かう。
現場の遺留指紋から佳南絵の証言通り寺井から襲われた形跡が見つかるが、指紋以外に寺井のDNAを照合するための遺留物は何も残っておらず…。
