全ての画像を見る

小田切（本田翼）は、篠田（高杉真宙）と食事に出かけた。その帰り道、小田切は、ずっと保留していた交際の申し込みに、OKの返事をする。

そこに、緊急招集の連絡が入る。実は、ミハンが探知していたものの、捜査できていなかった3人の危険人物が全員失踪していたのだ。井沢（沢村一樹）たちの元へやってきた公安部部長の曽根崎（浜田学）は、かつてミハンチームに加わりながら、法で裁けない犯罪者を闇に葬っていた田村薫巡査部長の話を切り出すと、その役目が引き継がれていると指摘する。

失踪した３人以外に、井沢たちが逮捕出来なかった大手フィットネスクラブ社長の仁科紗耶香（佐藤江梨子）までもが失踪していた。ミハンルームに出入りして情報を得ることができるのは、生体認証が登録された者だけであることから、ミハンチームの誰かが一連の連続失踪事件に関わっている可能性が高いとしつつ、まるで井沢が犯人だと言わんばかりの口ぶりで話す曽根崎。

それに対して香坂（水野美紀）は、ミハンメンバーの中に殺人者がいないことを証明するために、危険人物の連続失踪事件の真相を突き止める、と曽根崎に宣言する。

官邸では、定例の政官合同会議が行われる。目前に迫った東京サミットでは、ミハンも警備に加わることになっていた。だが、官房長官は、南雲元総理の反対があり、次の国会でもミハンの法制化は難しいとの見解を示していた。

井沢は、吉岡（森永悠希）とともに、紗耶香が姿を消したと思われる場所を訪れる。そこで井沢は、自分ならここでやる、などと言うと、吉岡に山内（横山裕）らとの合流を命じ、行き先も告げずにどこかへ行ってしまう。

そのころ山内は、小田切とともに3件の失踪者を調べていた。地権者から土地をだまし取り、殺害しようとしていた地面師グループのリーダー、借金を返せない相手に保険金をかけて殺そうとしたSNS闇金の経営者、水上バイクで女性をひき殺した事故をもみ消したうえ目撃者の命まで狙った政治家の息子――彼らが拉致されたと思われる場所には、いずれも防犯カメラがなかった。

井沢の無実を信じる山内たちは、ミハンを法制化に導くことが井沢の救いにもなる、と信じて捜査に臨む。山内たちが目をつけたのは、ドライブレコーダーだった。

そのころ井沢は、元警察庁長官・町田（中村育三）の遺体が発見された森にいた。そこに、香坂がやってきた。香坂も、井沢と同じように、一連の失踪事件と、町田殺害事件が繋がっていると考えていた。井沢は、警察から支援を打ち切られたことを恨み、ミハンの存在や冤罪事件が起きたことを町田がマスコミにリークしようとしていたことを香坂に話した。

町田が殺されたことでミハンは守られたのかもしれない、と続ける井沢。香坂は、そんな井沢に、ミハンの法制化を願っているか、と問いかけた。「もちろん願ってますよ」。そう答えた井沢に、香坂は、法制化された後もミハンにいてほしい、あなたが必要だと訴えた。

井沢は、町田が殺害された山のふもとでイノシシによる農作物の被害があり、畑の所有者が行政に駆除を依頼するためにホームビデオを設置していたことを掴んでいた。

町田が殺害された日も、ビデオは回っていたのだ。そのデータと、山内たちが探し出したドライブレコーダーのデータには、顔や性別、着衣などまでは判別できなかったが不審な人物が映っていた。そこで井沢たちは、人間の歩き方の違いで判別する歩行認証システムを使い、映像に映っていた不審人物が同一人物であること、またミハンのメンバーのいずれもそれとは一致しないことを確認する。

加賀美（柄本明）は、過去の防犯カメラ映像と照合し、歩き方が一致する人物を探し始める。その結果、いくつかの映像が見つかるとともに、紗耶香が消息を絶った現場近くで、犯人と思われる人物が車に乗り込もうとしている映像が見つかる。

あくる日、捜査一課の早川（マギー）と門田（粗品）は、犯人が使用していた車の情報から割り出したため池で、紗耶香の遺体を確認する。残りの失踪者も、ここに沈められている可能性が高かった。すると門田のもとに曽根崎から電話が入る。曽根崎は、犯人が井沢ではなかったことを確認するが……。

そんな折、思わぬ事態が起きた。見張り番としてミハンに泊まっていた吉岡がトイレに立った隙に、訪ねてきた法務省の北見（上杉柊平）が、犯人に繋がる歩行認証データや防犯カメラ映像などをすべて削除してしまったのだ。すでに北見は、自分の位置情報や通信記録も消去し、姿を消していた。

井沢たちは、北見が犯人をかばおうとしていると推測し、彼の行方を追ったものの、手がかりは残されていなかった。だが、復元されたデータの一部から、ミハンがまだ試験段階だった７年前に、北見とミハンに接点があったことが判明する。その当時、北見は、ストーカー被害に遭っていた女性を助けたことがきっかけで、そのストーカー男に命を狙われたのだ。

当時、ネット情報だけで危険人物を割り出していたミハンは、その男を探知していた。北見は、歩道橋の上で男に襲われて負傷した。が、何者かがその男を階段から突き落として彼を救ったのだ。そのとき、ミハンのアラートが鳴り響き、新たな危険人物として北見を表示する。井沢たちは、加賀美が過去の防犯カメラ映像から割り出した、北見の出入り先へと向かった。すると、残された加賀美は、何故か別の映像の施設へと向かった。

加賀美は、雑居ビルの一室を訪れていた。彼のPCには、笑顔で焼き芋を食べている6歳くらいの男の子の写真が表示されていた。そこにやってきた北見は、加賀美の頭に拳銃を押し付けた。しかし加賀美は動じることもなく、26年前に映画館で起きた神経ガス散布事件の話を始める。

その現場にいた僕は『罪』を犯した――その『罪』を君は知っているね、と北見に問いかける加賀美。次の瞬間、香坂が現れ、北見に投降を呼びかけた。北見は、香坂を振り払って逃げようとしたが、井沢に取り押さえられる。

北見は、取り調べを受けても何も答えようとはしなかった。マジックミラー越しにそのようすを見ていた香坂は、部屋の外にいた加賀美に、何故あの写真を持っているのか、と問いかけた。香坂は、北見ともみ合いになった際に、加賀美のPCに表示されていた写真を見ていた。すると加賀美は、「君と同じさ。僕も探しているんだよ、彼のことを」と答え……。

一方、山内と小田切は、北見がいくつものペーパーカンパニーを利用して、軍用爆弾を作ることもできるトキサミシンを大量に入手していたことを掴む。犯人の狙いは東京サミットである可能性が高かった。井沢たちは、爆弾の製造工場と思われる倉庫に向かったが、すでに爆弾は製造され、どこかに持ち出されたようだった。

香坂は、北見と会った後、曽根崎のもとを訪れる。そこで曽根崎は、どう責任を取るつもりなのか、と香坂を叱責した。その際、香坂のもとへ井沢から電話が入る。しかし香坂は、その電話には出ずに、そのまま姿を消してしまう。

井沢は、ミハンルームに残されていた香坂のタブレットに、テロに関するデータが残されていることを知る。

サミット当日。各国の要人たちが会場に集まり始めていた。その８時間後、曽根崎はミハンルームに向かっていた。セキュリティーを解除するよう、電話で指示する曽根崎。するとその背後に、血まみれの井沢が現れて……。